Her ikisi de dezenfektan olan povidon iyot ile povidon iyot arasında benzerlikler olduğu gibi farklılıklar da vardır. Kesin konuşmak gerekirse, povidon-iyot ve iyodoforun her ikisi de kompleks oluşturucu maddenin bileşimi farklı olduğu için kompleks iyottur. Povidon-iyot büyük bir isimdir ve povidon-iyot, en yaygın kullanılan povidon-iyot çeşididir. İyodofor, klorheksidin alkol ve iyot artı yüzey aktif maddenin kompleksleşmesiyle oluşturulurken, povidon-iyot, iyot ve PVP'nin kompleksleşmesiyle oluşur.
İyodoforun mevcut iyot konsantrasyonu yüzde 0,2 iken, povidon-iyodininki yüzde 5 -1'dir. Kullanılan nesneler farklıdır. İyodofor cilt dezenfektanı iken, povidon-iyot cilt ve mukoza zarı dezenfektanıdır. Bakterisidal etki de farklıdır, iyodofor povidon-iyodinden daha güçlüdür. Povidon-iyot, sürekli olarak serbest iyot salarak antibakteriyel etkisini gösterir. Etki mekanizması bakteri proteinini denatüre etmek ve öldürmektir ve bakteri, mantar ve virüslere karşı etkilidir. Güçlü geniş spektrumlu bakterisidal güce, düşük toksisiteye ve neredeyse hiç tahriş ve aşınmaya sahip değildir. Ek olarak, povidon iyodin de oral bir solüsyona sahiptir, ancak özellikle kaplumbağalar olmak üzere çiftlik hayvanlarının dezenfeksiyonu için uygundur.